Mikołajki ist ein wunderbarer Ort für Wassersportarten. Mit seinen zahlreichen Seen und Kanälen bietet die Region eine Vielzahl von Möglichkeiten, um das Wasser zu genießen. Segeln ist eine der beliebtesten Aktivitäten hier. Es gibt allerdings auch weitere Wassersportarten, wie Wasserskifahren, Wakeboarden, Kanufahrten, Kajakfahren, Jet Ski, Stand up Paddle, und Hydrofoil Surf. Es besteht im Ort die Möglichkeit, den Bootsführerschein zu erwerben.